В Сибайской гимназии-интернате имеется 18 кабинетов и 2 мастерских: 2 кабинета информатики, 2 кабинета математики, 2 кабинета русского языка и литературы, 2 кабинета истории и обществознания, 2 кабинета иностранного языка, 2 кабинета башкирского языка и литературы, кабинеты физики, биологии, химии, географии, ОБЖ, мастерская для урока технологии для мальчиков и кабинет домоводства для девочек. В 9 кабинетах установлены интерактивные панели. У всех педагогов имеется современные ноутбуки. Кабинет информатики №18 в 2013 году стал призером республиканского конкурса «Лучший кабинет информатики». Кабинеты биологии №12 и башкирского языка №2 ежегодно становятся призерами городских конкурсов кабинетов.